南京的制药专业大学排名如下：

中国药科大学

排名：第1名

省份：江苏

城市：南京

备注：双一流、211工程、985工程优势学科创新平台

南京中医药大学

排名：第2名

省份：江苏

城市：南京

备注：双一流

南京医科大学

排名：第3名

省份：江苏

城市：南京

备注：双一流

这些排名综合了不同来源的数据，并考虑了各大学的学科优势、学术声誉等因素。建议您在选择学校时，可以综合考虑这些排名信息，同时也可以参考其他权威排名和自身兴趣、职业规划等因素。