养殖三大证件是：动物防疫条件合格证；兴建养殖档案；养殖场、养殖小区备案登记证。

动物防疫条件合格证是单位和个人开办动物饲养场、养殖小区、动物隔离场所、动物屠宰加工场以及动物和动物产品无害化处理场的生产经营活动；经兽医管理部门审查，符合动物疫病预防、控制、扑灭等条件批准后，发给的动物防疫条件许可凭证。有注册备案的许可证号。

根据2010年1月4日农业部第一次常务会议审议通过，于2010年5月1日起施行的《动物防疫条件审查办法》规定，“动物饲养场、养殖小区、动物隔离场所、动物屠宰加工场所以及动物和动物产品无害化处理场所，应当符合本办法规定的动物防疫条件，并取得《动物防疫条件合格证》。”“经营动物和动物产品的集贸市场应当符合本办法规定的动物防疫条件。”

养殖许可证的作用主要有：

1、养殖证是养鱼生产者使用水域、滩涂从事养殖生产活动的合法权益，能够得到法律的保护，养殖证是合法的凭证。

2、养殖证是判断水域养殖使用功能的基础依据，当养殖水域因国家建设及其它项目征用或受到污染、爆破造成损失时，养殖者可凭养殖证申请补偿或进行索赔。渔业污染事故调查机构是以养殖证为受理案件的基础，养殖证登记内容是调查处理事故的重要依据。

3、水产养殖生产者要持养殖证才能够申请苗种生产审批、水生野生动物驯养繁殖证，水产品原产地证书，无公害农产品基地资格等，并享受国家税收等方面的优惠政策。

要到地畜牧局申版养殖防疫条件合格证，拿着合格证才能到工商部门办理营业执照。

法律依据：

《个体工商户登记管理办法》

第三条个体工商户的注册、变更和注销登记应当依照《个体工商户条例》和本办法办理。申请办理个体工商户登记，申请人应当对申请材料的真实性负责。

第五条登记机关可以委托其下属工商行政管理所办理个体工商户登记。