二级建造师在更换公司时，需要遵循以下流程和注意事项：

解聘证明和原单位同意

需要原单位出具解聘证明，并上传到企业网上迁出。

原单位需要签署同意意见。

现单位同意和资料准备

现单位需要签署同意意见。

准备新旧单位的证明、印章更换（如果原章丢失需要提供丢失证明）。

网上迁出和迁入

原单位在网上确认迁出，现单位在网上确认迁入，并打出表格后双方企业盖章。

主管部门盖章

如果跨区或跨省，还需要地区建设局或省厅盖章。

提交材料

将所有盖完章的材料（包括章、证书复印件）送到新公司所在的省建设厅。

审核和取新证

等待审核通过后，可以取新证。

印章更换

在变更注册单位时，注册证与执业印章是一起上交的，原印章在变更时是要销毁的。

劳动合同

换公司后，需新公司出具工作证明，老公司盖章确认无异议，并带上相关材料去考试管理机构办理变更手续。

建议

确保所有文件齐全且符合规定，及时与原单位和现单位沟通，以免影响注册进度。

在整个过程中，有任何问题应及时咨询相关部门或专业法律顾问。