二级建造师扣分后的处理方式如下：

了解扣分原因

从负责管理的部门获取详细的扣分信息，包括扣分的原因、时间、地点等。这些信息将帮助你理解发生了什么问题，以便采取相应的纠正措施。

接受处罚

根据扣分的原因，你可能需要接受一定的处罚。这可能包括罚款、暂停执业资格等。在接受处罚的同时，你应该确保完全理解处罚的内容和原因，以避免将来再次出现类似的问题。

整改与教育

为了消除扣分的影响，你需要对导致扣分的行为或情况进行整改。这可能包括改进工作流程、加强内部管理、提高个人素质等。同时，你可能还需要参加相关的培训和教育，以提高自己的专业水平和法规意识。

重新申请

在完成整改并通过必要的考核后，你可以向管理部门提出恢复分数的申请。在申请时，你需要提供充分的证据来证明你已经改正了错误，并采取了有效的预防措施以防止类似问题的再次发生。

保持警惕

即使分数得到了恢复，你也需要时刻保持警惕，遵守所有的规定和标准，避免再次出现扣分情况。

此外，具体的处理方式还可能根据违规行为的严重程度以及相关的法规政策来决定。例如，在某些情况下，扣分可能会导致二级建造师的执业资格被暂停一段时间，或者注销注册。在严重违规的情况下，还可能面临行政处罚或刑事责任。

如果你认为扣分有误或存在争议，应及时向负责扣分的部门提出沟通与申诉，准备好相关证明材料，按照规定的程序进行申诉，争取自己的权益。