连锁餐饮企业需要进行商业特许经营备案，具体流程如下：

网上注册

登录商务部商业特许经营信息管理系统进行企业注册，获取登录号。

提交纸质材料

将准备好的材料提交给商务主管部门。如果是境外企业则提交至商务部，境内企业则提交至省级商务主管部门。

等待审核

商务主管部门将审核提交的网上信息和纸质材料。

完成备案

审核通过后，企业将完成备案，其信息将在商务部的商业特许经营信息管理系统上公示。

建议：

企业应尽早进行备案，以确保在签订合同的15个工作日内完成备案，避免因未备案而面临罚款等后果。

备案过程中，企业应确保提交的材料真实、完整，并按照系统要求填报相关信息。