养殖金鱼时，杀菌消毒是非常重要的环节，可以通过以下方法进行：

定期晒太阳

在晒太阳之前，先把鱼缸清理一下，抽出底部的废水，这样不仅能起到杀菌消毒的作用，还可以提高金鱼的自身抵抗力和免疫力。

使用盐水消毒

日常预防疾病可以使用千分之三到千分之五浓度的盐水，使用时间不能超过2周。

如果金鱼身上有伤口，可以使用千分之五到千分之八浓度的盐水进行杀菌消毒，严重的时候可以和抗生素一起使用，浸泡时间一般是10-20分钟，使用时长不能超过7天。

使用特定药物

在100千克水中溶解孔雀石绿0.3克或次甲基蓝，浸洗鱼体10~20分钟，数日后可见菌丝脱落。

使用2%-3%的盐水浸洗，每天一次，每次5-10分钟。

百万分之一至二（1-2ppm）的孔雀石绿溶液每天浸洗20-30分钟。

百万分之二（2ppm）的高锰酸钾加上1%的盐水混合后将病鱼浸泡20-30分钟。

土霉素、呋喃唑酮片等抗生素药物可用于体内杀菌。

呋喃西林粉、痢特灵、土霉素等药物可用于浸洗消毒。

庆大霉素浸洗也是一种有效的方法。

提高水温

提高水温以抑制水霉的生长，并且可用一盏15瓦的紫外线灯每日照射数小时，可有效的抑制或消灭水霉菌。

物理治疗方法

使用加温器将水温非常缓慢的逐步加热到28摄氏度，并保持3天，之后逐步回复正常水温并调换新水，一周内白点原虫全部脱离。

隔离病鱼

当发现缸中一尾金鱼生病时，应立即把病鱼移到另一个隔离治疗缸去，以防止其它金鱼也受感染。

日常清洁

鱼缸、鱼盆要经常刷洗消毒，新买来的鱼缸、鱼盆等容器要经常清洗，对未用过的容器和刚刚养过病鱼的容器，使用前必须消毒。

通过以上方法，可以有效地对金鱼进行杀菌消毒，保障其健康生长。在实际操作中，要根据具体情况选择合适的方法，并注意观察金鱼的反应，确保消毒过程安全有效。