颜色不一样有以下几种原因：

1、土壤质量：土壤质量不同会导致水稻苗的颜色不同。例如，土壤中的有机质、氮、磷等营养元素的含量不同，会影响水稻苗的生长和颜色。

2、水分供应：水稻苗需要充足的水分才能生长健康，如果水分供应不足或过多，会导致苗色不同。旱季水稻苗颜色较浅，而水田中的水稻苗颜色较深。

3、温度：水稻苗对温度敏感，过高或过低都会影响苗色。例如，水稻苗在寒冷的环境下生长，会变得苍白。

4、光照：光照不足也会导致水稻苗颜色较浅，而光照充足的水稻苗颜色较深。

5、品种：不同品种的水稻苗颜色也有所不同，有些品种的苗色较深，有些则相对较浅。